busco报错

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【提示】本文写作命令为:abysw blog busco报错

本文需要解决的问题:
2022-06-09 16:05:13 INFO: ***** Start a BUSCO v5.3.0 analysis, current time: 06/09/2022 16:05:13 *****
2022-06-09 16:05:13 INFO: Configuring BUSCO with local environment
2022-06-09 16:05:13 INFO: Mode is proteins
2022-06-09 16:05:13 INFO: ‘Force’ option selected; overwriting previous results directory
2022-06-09 16:05:13 INFO: Downloading information on latest versions of BUSCO data…
2022-06-09 16:07:20 ERROR: Cannot reach https://busco-data.ezlab.org/v5/data/file_versions.tsv
2022-06-09 16:07:20 ERROR: BUSCO analysis failed !
2022-06-09 16:07:20 ERROR: Check the logs, read the user guide (https://busco.ezlab.org/busco_userguide.html), and check the BUSCO issue board on https://gitlab.com/ezlab/busco/issues

报错原因是网站服务器不稳定,尝试修改了代码和配置,均无效(需要动的代码有点多)。

另辟思路:
将要下载的文件放到自己的网站上。

file_versions.tsv

然后修改一下config.ini文件,再试试。

没有回来更新就是解决了。

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尴尬了!!!
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就记得有禁网的参数,以为被替换掉了。
然后看代码:
self.offline = True

发现有关网的变量;
然后:
–offline To indicate that BUSCO cannot attempt to download files

这篇日志当我没写。