基因功能注释笔记

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参考生信技工网站:https://yanzhongsino.github.io/2021/05/17/omics_genome.annotation_function/

1。 网页版注释:
http://eggnog5.embl.de/app/downloads#/app/methods
http://ekhidna2.biocenter.helsinki.fi/sanspanz/
https://www.plabipd.de/portal/web/guest/mercator4/-/wiki/Mercator4/FrontPage

  1. 数据库注释:
    wget ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/software/unix/iprscan/5/5.56-89.0/interproscan-5.56-89.0-64-bit.tar.gz

全库之前没下完,这个是参考网站只下载了plant的。
wget ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/taxonomic_divisions/uniprot_sprot_plants.dat.gz #;
wget ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/taxonomic_divisions/uniprot_trembl_plants.dat.gz # 11.5G;
zcat uniprot_sprot_plants.dat.gz uniprot_trembl_plants.dat.gz > uniprot_plants.dat

GFAP - functional annotation software for plants
https://gitee.com/simon198912167815/gfap-database#installation


好了,等着吧。